2016年可谓是我国资本市场的监管年，成长中的新三板市场更是进入严格监管期。统计数据显示，2016年新三板市场非标审计意见占比较上年增长1.05倍，A股市场近三年以来非标审计意见占比基本平稳。根据choice数据统计，截至5月15日，共有151家挂牌公司2016年年报被审计机构出具非标意见。虽然非标意见审计报告高达151份，但占已披露的10626份审计报告的比重仅为1.42%。
综合股转系统及choice数据，截至2016年6月30日，共有6938家挂牌公司披露2015年年报，其中48份财报被审计机构出具非标审计意见，占当年年度审计报告比0.69%。(注：因2014年新三板市场尚处发展初期，故未纳入比较范围)
另外，在2016年年报审计报告中，新三板市场共有22份非无保留审计意见报告，较2015年年报中的15份非无保留审计意见报告增长46.66%。值得注意的是，与非标审计意见相比，非无保留审计意见严重程度更高。非无保留审计意见包含保留意见，否定意见及无法表示意见。带强调事项段无保留意见属于无保留意见，但因存在需要说明的事项，所以在审计报告中添加强调事项段，提醒报表使用者注意。
然而，A股市场却是另一番景象。近三年以来，A股非标审计意见报告占报告总数比重保持在3.67%至3.35%之间，虽略有下降但基本保持稳定。根据中注协数据统计，截至4月30日，A股市场共有105份2016年年报非标审计报告，占当年3136份审计报告总数量比重为3.35%。
由于2016年下半年IPO审核提速，A股2016年度审计报告数量较2015年同期增长294份，但其中非标意见审计报告105份，仅较上年同期仅增长1份。非标意见审计报告占当年告总数量比重从3.66%降至3.35%。
此外，2016年度A股市场共有30份非无保留意见审计报告，是同期新三板市场的1.36倍，较A股市场上年同期同样增长1.36倍。也就是说，虽然非标审计意比重有所下降，但从严重程度更高的非无保留审计意见分析，A股市场2016年度非无保留意见审计报告数量较上年同期增加36%，且高于同期的新三板市场。